L'IGLYO est partie du constat que de nombreux étudiants homosexuels ou transgenres souffraient de harcèlement dans le cadre scolaire. Ces violences, qu'elles soient verbales ou physiques nuisent à la santé des jeunes et ne leur permettent pas de s'assumer. Aussi, l'organisation vient de faire paraître un guide d'information pour les enseignants, afin qu'ils soient en mesure d'éduquer leurs étudiants à la tolérance et de pouvoir détecter les cas de harcèlement.

L'IGLYO milite pour des systèmes scolaires plus inclusifs et considère qu'une sensibilisation dès le plus jeune âge est l'une des mesures les plus efficaces pour permettre une plus grande tolérance envers la communauté LGBTI dans la société en général.